Visualisasi Molekul 3D (untuk Pendidikan Kimia Indonesia)

Visualisasi Molekul 3D ini dikembangkan sebagai media pembelajaran kimia interaktif untuk siswa dan guru MA/SMA/SMK, dengan tujuan membantu memahami struktur tiga dimensi molekul secara intuitif dan menarik. Boleh dibuat sendiri dengan membuat molekul 2D di kotak Sketcher.

Aplikasi berbasis web ini dibangun menggunakan Three.js untuk rendering 3D, JSME Molecular Editor sebagai sketcher molekul 2D, serta data koordinat atom, panjang ikatan, sudut ikatan, dari PubChem. Basis data senyawa kimia PubChem ini terbesar milik National Institutes of Health (NIH), Amerika Serikat.

Baca Selengkapnya » 0

Menampilkan PEB dan Cuping (Lobe) pada Molekul Menggunakan JMOL

Jmol merupakan penampil struktur molekul 3D yang sangat bagus. Untuk menampilkan geometri molekul dengan dilengkapi cuping (lobe) dan 2 tanda titik sebagai representasi 1 pasang elektron bebas (PEB). Agar dapat melakukan itu semua pengguna harus paham jenis orbital hibrida setiap molekul yang ingin ditampilkan, Jmol tidak dapat melakukan hal ini secara otomatis. Perintah yang dapat diberikan melalui Console Jmol untuk tujuan tersebut juga relatif sederhana. Perintah lcaocartoon untuk menampilkan cuping, dan lcaocartoon lonepair untuk menampilkan tanda 2 titik sebagai representasi PEB. 

Berikut ini penjelasan untuk menampilkan PEB untuk masing-masing orbital hibrida dalam molekulnya. Untuk molekul tanpa PEB tidak diberikan dalam catatan penjelasan ini.

Baca Selengkapnya » 0

Visual 3D Molekul dengan iCn3D

iCn3D ("I see in 3D - Saya melihat dalam 3D") merupakan penampil struktur 3D berbasis WebGL menggunakan Three.js dan jQuery. Ini merupakan alternatif cara tercepat dan paling praktis untuk menampilkan model molekul 3D di website atau weblog. Cukup menggunakan iframe. Tidak perlu melakukan banyak ubahan di template blog/web. Kalau mau sedikit repot dapat melakukan embed dengan Javascript. Semua data dijalankan dari milik penyedia layanan ini, www.ncbi.nlm.nih.gov, setidaknya sampai beberapa waktu ke depan. Bagaimana caranya silakan simak catatan berikut.

Baca Selengkapnya » 0

Membandingkan Visual Molekul 3D dengan Beberapa Software Kimia

Visual molekul 3D (3 Dimensi) saat ini mudah dibuat. Hanya beberapa kali klik molekul 3D secara default dapat ditampilkan di layar komputer. Banyak software yang dapat menampilkan model molekul secara 3 dimensi. Tulisan ini akan mengulas beberapa visual molekul dengan beberapa software. Bukti visual akan ditampilkan dalam format video. Manakah yang paling bagus dan cukup memberi informasi tentang data sifat setiap molekul juga akan diulas.

Baca Selengkapnya » 0