Memahami Struktur Histidin

Berikut ini penjelasan singkat tentang struktur histidin yang merupakan salah satu asam amino. Visual ditampilkan dalam format 2D maupun 3D interaktif. Secara umum struktur asam amino sering ditampilkan dengan model struktur kerangka (skeletal), atom C, atom H, dan pasangan elektron bebas (PEB) tidak ditampilkan. Unsur selain C dan H, misalnya O, N, S selalu ditampilkan. Setiap terminal (ujung ikatan) atau sudut struktur tanpa lambang unsur berarti terdapat atom C.

Baca selengkapnya » 0

Memahami Struktur Alanin

Berikut ini penjelasan singkat tentang struktur alanin yang merupakan salah satu asam amino. Visual ditampilkan dalam format 2D maupun 3D interaktif. Secara umum struktur asam amino sering ditampilkan dengan model struktur kerangka (skeletal), atom C, atom H, dan pasangan elektron bebas (PEB) tidak ditampilkan. Unsur selain C dan H, misalnya O, N, S selalu ditampilkan. Setiap terminal (ujung ikatan) atau sudut struktur tanpa lambang unsur berarti terdapat atom C.

Baca selengkapnya » 0

Menampilkan PEB dan Cuping (Lobe) pada Molekul Menggunakan JMOL

Jmol merupakan penampil struktur molekul 3D yang sangat bagus. Untuk menampilkan geometri molekul dengan dilengkapi cuping (lobe) dan 2 tanda titik sebagai representasi 1 pasang elektron bebas (PEB). Agar dapat melakukan itu semua pengguna harus paham jenis orbital hibrida setiap molekul yang ingin ditampilkan, Jmol tidak dapat melakukan hal ini secara otomatis. Perintah yang dapat diberikan melalui Console Jmol untuk tujuan tersebut juga relatif sederhana. Perintah lcaocartoon untuk menampilkan cuping, dan lcaocartoon lonepair untuk menampilkan tanda 2 titik sebagai representasi PEB. 

Berikut ini penjelasan untuk menampilkan PEB untuk masing-masing orbital hibrida dalam molekulnya. Untuk molekul tanpa PEB tidak diberikan dalam catatan penjelasan ini.

Baca selengkapnya » 0

Geometri Molekul Diatomik dan Orbital Hibrida

Geometri molekul diatomik selalu linier yang hanya dikarakterisasi oleh parameter panjang ikatan saja. Contohnya molekul O₂, N₂, F₂, dan HF. Ini berbeda dengan geometri molekul linier yang terdiri dari 3 atom (triatomik) seperti CO₂ selain dikarakterisasi oleh panjang ikatan juga sudut ikatan. Syarat terbentuknya ikatan kimia hanya perlu 2 atom yang terhubung, sedangkan sudut perlu 3 atom yang terhubung melalui atom pusat.

Baca selengkapnya » 0

Cara Menghitung Bilangan Koordinasi pada Atom Pusat Molekul/Ion Poliatom

Terdapat beberapa alternatif yang mungkin disebut sebagai trik agar mudah menggambar struktur Lewis suatu molekul atau ion poliatom. Seperti dalam tulisan ini dan kalkulator ini. Dalam tulisan ini sendiri dilakukan dengan menghitung bilangan koordinasi (BK) atom pusat. Bilangan koordinasi yang dimaksud di sini adalah jumlah pasangan elektron ikatan + jumlah pasangan elektron bebas + radikal bebas. Dengan tahu BK atom pusat suatu molekul atau ion poliatom maka jenis orbital hibridanya dapat diprediksi dengan cepat dan kesalahan penggambaran struktur Lewis-nya dapat diminimalkan. Bagaimana caranya simak lebih lanjut.

Baca selengkapnya » 0

Bentuk-bentuk Molekul dengan Orbital Hibrida sp3d2 dan sp3d3 (3D Interaktif)

Berikut ini visual bentuk-bentuk molekul yang mempunyai orbital hibrida sp³d² dan sp³d³ yang dicontohkan untuk molekul yang sesuai secara 3D interaktif. Molekul yang memiliki orbital hidrida yang digunakan sebagai contoh molekul dengan rumus AX₆ dicontohkan SF₆ (belerang heksafluorida), AX₅E dicontohkan IF₅ (iodin pentafluorida), AX₄E₂ dicontohkan XeF₄ (xenon tetrafluorida) dan molekul dengan rumus AX₇ dicontohkan IF₇ (iodin heksafluorida).
Harap bersabar untuk beberapa detik hingga semua molekul termuat dengan sempurna.

Baca selengkapnya » 0

Bentuk-bentuk Molekul dengan Orbital Hibrida sp3d (3D Interaktif)

Berikut ini visual bentuk-bentuk molekul yang mempunyai orbital hibrida sp³d yang dicontohkan untuk molekul yang sesuai secara 3D interaktif. Molekul yang memiliki orbital hidrida yang digunakan sebagai contoh PCl₅ (fosfor pentaklorida) mewakili rumus AX₅, SF₄ (belerang tetrafluorida) mewakili rumus AX₄E, BrF₃ (bromin trifluorida) mewakili rumus AX₃E₂, dan XeF₂ (xenon difluorida) mewakili rumus AX₂E₃.
Harap bersabar untuk beberapa detik hingga semua molekul termuat dengan sempurna.

Baca selengkapnya » 0

Bentuk-bentuk Molekul dengan Orbital Hibrida sp3 (3D Interaktif)

Berikut ini visual bentuk-bentuk molekul yang mempunyai orbital hibrida sp³ yang dicontohkan untuk molekul yang sesuai secara 3D interaktif. Molekul yang memiliki orbital hidrida yang digunakan sebagai contoh CH₄ (metana) mewakili rumus AX₄, NH₃ (amonia) mewakili rumus AX₃E, H₂O (air) mewakili rumus AX₂E₂, dan HF (asam fluorida) mewakili rumus AXE₃.
Harap bersabar untuk beberapa detik hingga semua molekul termuat dengan sempurna.

Baca selengkapnya » 0

Struktur Lewis, Hibridisasi, Bentuk Molekul, dan Kepolaran Senyawaan S dan F

Unsur S dengan konfigurasi elektron 2-8-6 (ini konfigurasi elektron tiap kulit atau model Bohr). Unsur F memiliki konfigurasi elektron 2-7. Tuliskan senyawa yang mungkin dapat dibentuk oleh S dan F. Soal ini dari diskusi di grup Facebook Asosiasi Guru Kimia Indonesia. Cukup menarik sebab ada beberapa kemungkinan senyawa yang terbentuk pasangan dari unsur-unsur.

Baca selengkapnya » 0

Persen Karakter Orbital s, p, dan d dalam Orbital Hibrida dan Contohnya

Persen karakter orbital s, orbital p, dan orbital d dalam orbital hibrida turut mempengaruhi sifat-sifat molekul baik kereaktifan dan sifat fisiknya. Dalam teori ikatan valensi terdapat istilah hibridisasi. Hibridisasi dalam ilmu kimia dapat diartikan sebagai penggabungan beberapa orbital dalam suatu atom untuk membentuk orbital baru dengan memberikan karakter tertentu ketika membentuk ikatan dengan atom lain.

Baca selengkapnya » 0

Metode Jari untuk Menentukan Orbital Hibrida, Bentuk Molekul, dan Kepolaran Molekul

Ada beberapa cara/metode yang dapat digunakan untuk memperkirakan orbital hibrida, bentuk molekul serta kepolaran. Khusus siswa SMA boleh menggunakan metode berikut, menggunakan metode jari. Toh molekul yang dijadikan contoh biasanya relatif sederhana. Pada tulisan ini merupakan versi visual dari tutorial sebelum "Cara Super Cepat Menentukan Kepolaran Molekul, Bonus Cara Cepat Memprediksi Orbital Hibrida dan Bentuk Molekul. Ini akan membantu proses hitung untuk menentukan orbital hibrida, menentukan bentuk bentuk molekul dan kepolaran suatu molekul. Metode jari ini sebaiknya digunakan setelah siswa memahami aturan dalam menentukan orbital hibrida, bentuk molekul, dan kepolaran. Karena mekanisme penentuannya berulang begitu saja maka diperlukan trik agar bisa diperkirakan secara cepat.

Baca selengkapnya » 0

Hibridisasi Molekul dengan Jumlah Elektron Ganjil

Ada beberapa trik dalam menentukan hibridisasi (orbital hibrida) dari suatu molekul atau ion yang pernah dibahas pada blog ini. Cara atau trik-trik sebelumnya kurang dapat mengakomodasi kasus molekul atau ion yang memiliki total elektron valensi ganjil.

Lalu bagaimana caranya? Apakah elektron tunggal pada atom pusat itu terlibat dalam pembentukan orbital hibrida?

Baca selengkapnya » 0

Menentukan Orbital Hibrida dengan ½(V+M–K+A)

Cara ini berbeda dengan metode sebelumnya. Pada metode sebelumnya yang pernah ditulis di blog ini adalah dengan menghitung semua elektron valensi atom pada molekul atau ion yang terlibat dalam pembentukan ikatan. Cara menentukan orbital hibrida dengan rumus ½(V+M–K+A) ini hanya dengan menentukan jumlah elektron valensi atom pusat berikut jumlah atom monovalen yang terikat ke atom pusat, serta muatannya bila ada.

Baca selengkapnya » 0

Cara Cepat Menentukan Orbital Hibrida Atom dari Struktur Molekulnya

Beberapa soal tentang menentukan orbital hibrida sering ditampilkan dalam struktur molekul ala Lewis (Struktur Lewis). Ini akan mudah untuk diperkirakan orbital hibrida apakah yang dimiliki oleh suatu atom yang ditunjuk. Sedikit berbeda jika tidak ditampilkan struktur molekulnya dan ini dapat menggunakan trik yang pernah ditulis dalam blog ini.  Petunjuk singkatnya adalah dengan menghitung jumlah macam ikatan pada struktur molekul.

Baca selengkapnya » 3

Kalkulator Penentuan Orbital Hibrida Atom Pusat & Bentuk Molekul

Dari trik dan teknik pada tulisan di sini dan di sini dapat ide untuk membuat kalkulator sederhana, kalkulator penentu orbital hibrida atom pusat suatu molekul senyawa kovalen dan bentuk molekul.

Syarat untuk dapat menentukan orbital hibrida suatu molekul ini adalah dapat menentukan dan menjumlahkan elektron valensi setiap atom pada suatu molekul dari senyawa kovalen.

Perlu diingat alat ini bertujuan untuk membantu siapapun yang sedang belajar tentang orbital hibrida dan bentuk molekul dari senyawa kovalen setelah mencoba untuk menentukan sendiri dan mencocokkannya dengan hasil dari alat bantu ini.

Baca selengkapnya » 2