Aplikasi ini memungkinkan pengguna mengambil koordinat 3D molekul dari database PubChem menggunakan kode SMILES sebagai input. Cukup masukkan satu atau beberapa kode SMILES (Simplified Molecular-Input Line-Entry System) per baris, dan aplikasi akan secara otomatis mengunduh data struktur dalam format SDF (Structure Data File). Output dapat berupa file SDF lengkap atau versi sederhana yang hanya berisi informasi koordinat hingga M END. Berguna untuk visualisasi molekul, penelitian kimia komputasi, atau analisis struktur dengan software seperti PyMOL, Chimera, atau Avogadro.
Pengunduh File 3D Molekul Format SDF dari PubChem
Dirancang oleh Urip.info
Masukkan Kode SMILES
Masukkan satu atau beberapa kode SMILES (satu per baris) kemudian klik tombol Ambil SDF:
Format Output SDF:
SDF Lengkap: Semua data termasuk properti dari PubChem
Hasil Pengambilan Data
Berhasil diambil: 0 molekul
Gagal: 0 molekul
Preview SDF
Petunjuk Penggunaan
- Format "Sampai M END": Hanya struktur molekul (koordinat atom + ikatan)
- Format "SDF Lengkap": Semua data termasuk properti tambahan dari PubChem
- Preview otomatis: Setelah proses selesai, preview langsung ditampilkan
- Download/Salin: Gunakan tombol untuk download file atau salin ke clipboard
- Toggle Format: Lihat versi lengkap/singkat tanpa mengubah output asli
Beberapa contoh senyawa dengan format SMILES
| No | Nama Molekul | SMILES |
|---|---|---|
| 1 | Air (Water) | O |
| 2 | Metana (Methane) | C |
| 3 | Etanol (Ethanol) | CCO |
| 4 | Asam Asetat (Acetic Acid) | CC(=O)O |
| 5 | Benzena (Benzene) | c1ccccc1 |
| 6 | Aseton (Acetone) | CC(=O)C |
| 7 | Glukosa (Glucose) | C(C1C(C(C(C(O1)O)O)O)O)O |
| 8 | Kafein (Caffeine) | CN1C=NC2=C1C(=O)N(C(=O)N2C)C |
| 9 | Aspirin | CC(=O)Oc1ccccc1C(=O)O |
| 10 | Vitamin C (Ascorbic Acid) | C(C(C1C(=C(C(=O)O1)O)O)O)O |
| 11 | Metanol (Methanol) | CO |
| 12 | Propana (Propane) | CCC |
| 13 | SO3 | O=S(=O)=O |
| 14 | SO2 | O=S=O |
| 15 | H2SO4 | OS(=O)(=O)O |
Tidak ada komentar:
Posting Komentar