Mengajar topik geometri molekul menggunakan Jmol pada pelajaran kimia di MA/SMA/SMK dimungkinkan membantu guru dan siswa dalam memahami pola bentuk molekul. Jmol merupakan salah satu aplikasi yang dapat menampilkan model molekul secara 3D dan pengguna dapat berinteraksi secara langsung dengan model molekul. Namun Jmol hingga saat ini belum menyediakan menu model GUI (yang tinggal klak-klik) yang dibutuhkan untuk pengajaran geometri molekul. Semua itu dapat di atasi melalui perintah teks di konsul (console) semua dapat dilakukan. Perlu pembiasaan agar terampil memanfaatkannya. Berikut ini beberapa perintah dasar yang mendukung pengajaran geometri molekul.
1. Pelabelan
Perintah di Console | Fungsi |
select * | Memilih semua atom |
select hydrogen | Memilih semua atom hidrogen |
label | Menampilkan semua atom dengan label lambang unsur dan nomor indeks serta kode indeks-nya, misal H2 #2 |
label %a | Menampilkan semua atom dengan label lambang unsur dan nomor indeks, misal H2 |
label %e | Menampilkan semua atom yang terpilih dengan label lambang unsur saja, misal H |
label %p | Menampilkan muatan parsial bila ada untuk semua atom yang terpilih |
label teksku | Menampilkan label pada atom yang terpilih dengan tulisan teksku |
set labelalignment center; | Mengatur agar label di tengah bola atom |
color label red | Mengubah warna label menjadi merah |
font label 20 | Mengubah ukuran font label menjadi 20 px |
font label 15 monospaced italic | Mengubah ukuran font label menjadi 15 px jenis font monospace dan formatnya italik. |
label hide | Menyembunyikan semua label yang pernah dibuat |
label on | Menampilkan semua label yang pernah dibuat |
2. Pengukuran
Perintah di Console | Fungsi |
measure @1 @2 | Menampilkan ukuran panjang ikatan antara atom nomor indeks 1 ke atom nomor indeks 2 |
set measurementunits 'pm' | Mengubah satuan panjang ikatan dari default nanometer ke pikometer |
measure @3 @1 @2 | Menampilkan ukuran sudut ikatan antara atom nomor indeks 3, atom nomor indeks 1, dan atom nomor indeks 2 |
measure allconnected (*)(*) | Menampilkan semua ukuran panjang ikatan yang ada |
measure allconnected (*)(*)(*) | Menampilkan semua ukuran sudut ikatan yang ada |
measure off | Menyembunyikan semua pengukuran yang sudah pernah dibuat |
measure on | Menampilkan semua pengukuran yang pernah dibuat |
set defaultDistanceLabel "123 pm" | Mengatur agar label setiap pengukuran panjang ikatan menjadi 123 pm, untuk pengukuran berikutnya. Ini sekadar pelabelan. Label ini boleh diganti teks apa saja. |
set defaultAngleLabel "107°" | Mengatur agar label setiap pengukuran sudut ikatan menjadi 107°, untuk pengukuran berikutnya. Ini sekadar pelabelan. Label ini boleh diganti teks apa saja. |
set showMeasurements true | Mengatur agar semua pengukuran yang pernah dibuat ditampilkan, termasuk garis putus-putus sebagai penanda. |
set defaultAngleLabel "%VALUE%UNITS" | Membuat satuan sudut (derajat) agar ditulis tanpa spasi (rapat dengan hasil pengukuran. |
color measure blue | Mengubah warna hasil pengukuran menjadi biru. |
font measure 18 | Mengubah ukuran font hasil pengukuran menjadi 18 px. |
Selain dua perintah dasar di atas tentu saja diperlukan keterampilan dasar lain. Misalnya mengubah warna atom dari warna standar, mengubah besar atom, mengubah ketebalan ikatan, menggambar garis dan bidang, dan lain-lain.
Semua fitur dasar sudah dibahas di blog ini seperti yang pernah penulis lakukan. Boleh klik di sini untuk query pencarian "tutorial jmol". Semua itu penting untuk keterampilan mengajar bentuk molekul, dan juga mengajar topik lain yang membutuhkan visual 3D interaktif. Untuk lebih lengkap sila simak penjelasan semua fitur Jmol di sini.
Tidak ada komentar:
Posting Komentar