Prinsip untuk menambahkan cuping (lobe) dan pasangan elektron bebas (PEB) yang ditandai dengan 2 tanda titik harus lebih dahulu mengetahui koordinat posisi cuping/PEB tersebut. Cara termudah adalah dengan memanipulasi struktur yang sudah teroptimasi menggunakan ChemDraw.
Tampilkan postingan dengan label PEB. Tampilkan semua postingan
Tampilkan postingan dengan label PEB. Tampilkan semua postingan
Memanipulasi Struktur Molekul 3D yang Sulit Ditampilkan Cuping dan PEB Menggunakan Jmol
Rabu, 13 Oktober 2021
Bila ingin menampilkan cuping dan pasangan elektron bebas strutkur molekul 3D di Jmol biasanya dapat dilakukan secara langsung menggunakan perintah di Console lcaocartoon atau lcaocartoon lonepair ditambah identitas orbital hibrida atom pusat molekul. Namun beberapa di antaranya tidak dapat dilakukan dengan perintah tersebut. Berikut ini cara memanipulasi struktur molekul 3D agar cuping dan PEB dapat divisualkan. Dicontohkan pada struktur molekul XeF2.
Menampilkan PEB dan Cuping (Lobe) pada Molekul Menggunakan JMOL
Kamis, 30 September 2021
Jmol merupakan penampil struktur molekul 3D yang sangat bagus. Untuk menampilkan geometri molekul dengan dilengkapi cuping (lobe) dan 2 tanda titik sebagai representasi 1 pasang elektron bebas (PEB). Agar dapat melakukan itu semua pengguna harus paham jenis orbital hibrida setiap molekul yang ingin ditampilkan, Jmol tidak dapat melakukan hal ini secara otomatis. Perintah yang dapat diberikan melalui Console Jmol untuk tujuan tersebut juga relatif sederhana. Perintah lcaocartoon untuk menampilkan cuping, dan lcaocartoon lonepair untuk menampilkan tanda 2 titik sebagai representasi PEB.
Berikut ini penjelasan untuk menampilkan PEB untuk masing-masing orbital hibrida dalam molekulnya. Untuk molekul tanpa PEB tidak diberikan dalam catatan penjelasan ini.
Cara Menghitung Bilangan Koordinasi pada Atom Pusat Molekul/Ion Poliatom
Selasa, 29 Desember 2020
Terdapat beberapa alternatif yang mungkin disebut sebagai trik agar mudah menggambar struktur Lewis suatu molekul atau ion poliatom. Seperti dalam tulisan ini dan kalkulator ini. Dalam tulisan ini sendiri dilakukan dengan menghitung bilangan koordinasi (BK) atom pusat. Bilangan koordinasi yang dimaksud di sini adalah jumlah pasangan elektron ikatan + jumlah pasangan elektron bebas + radikal bebas. Dengan tahu BK atom pusat suatu molekul atau ion poliatom maka jenis orbital hibridanya dapat diprediksi dengan cepat dan kesalahan penggambaran struktur Lewis-nya dapat diminimalkan. Bagaimana caranya simak lebih lanjut.
Membuat Cuping (Lobe) Pemodelan Bentuk Molekul Secara Manual di Jmol
Kamis, 02 Januari 2020
Untuk membuat tanda pasangan elektron bebas pada bentuk molekul beberapa sudah tersedia pada fitur Jmol dengan menggunakan perintah lcaoCartoon create "jenis orbital hibrida". namun untuk bentuk molekul yang tidak umum diperlukan cara atau trik dengan menggunakan fitur isosurface dan lobe. Berikut ini tutorial dengan memanipulasi model bentuk molekul IF7 menjadi model bentuk molekul XeF5–.
Bentuk-bentuk Molekul dengan Orbital Hibrida sp3d2 dan sp3d3 (3D Interaktif)
Kamis, 26 Desember 2019
Berikut ini visual bentuk-bentuk molekul yang mempunyai orbital hibrida sp3d2 dan sp3d3 yang dicontohkan untuk molekul yang sesuai secara 3D interaktif. Molekul yang memiliki orbital hidrida yang digunakan sebagai contoh molekul dengan rumus AX6 dicontohkan SF6 (belerang heksafluorida), AX5E dicontohkan IF5 (iodin pentafluorida), AX4E2 dicontohkan XeF4 (xenon tetrafluorida) dan molekul dengan rumus AX7 dicontohkan IF7 (iodin heksafluorida).
Harap bersabar untuk beberapa detik hingga semua molekul termuat dengan sempurna.
Harap bersabar untuk beberapa detik hingga semua molekul termuat dengan sempurna.
Langganan:
Postingan (Atom)
