Belajar Struktur Molekul dan Sifatnya di ChemEd Digital Library

Kamis, 28 Januari 2021 edit

Belajar struktur molekul dan beberapa parameter suatu senyawa di SMA/MA/SMK dapat dilakukan dengan menggunakan website Chemistry Education Digital Library (ChemEd DL). Visual struktur molekul dan juga beberapa ion dapat ditampilkan secara 3D. Basis penampilnya adalah Jmol. Pengguna tidak perlu repot membuat sendiri. Tinggal pakai. Bagaimana cara memanfaatkan ChemEd DL silakan lanjut pada penjelasan dalam artikel ini.
ChemEd DL ini menggunakan data yang tersedia pada web PubChem. Bila data di Pubchem tersedia maka dalam mode pencarian akan ditunjukkan struktur molekulnya. Untuk penggunaan lebih lanjut sebaiknya mengenal Jmol juga agar dapat melakukan manipulasi visual dan lain-lain.

Pertama silakan kunjungi website ChemEd DL ini.

Menu dan informasi yang tersedia dan dapat divisualkan seperti berikut (berdasarkan akses 28 Januari 2021):

Gambar-1. Tampilan awal ketika membuka ChemEd DL.
Untuk struktur molekul yang lain dapat dicari pada kolom pencarian. Dapat dengan mengetikkan nama senyawa (dalam Bahasa Inggris) atau menulis rumu kimianya. Dengan catatan memang dalam web ini tersedia, maka pilihan akan disajikan di bagian bawah kotak pencarian setelah menekan Enter.


Gambar-2. Pilihan Tampilan Molekul 3D
Untuk memilih mode display, klik kotak atau bulatan kecil.
Spin Molecule = Molekul akan berputar otomatis.
VdW radii = Menampilkan molekul dengan bulatan penuh tanpa menunjukkan ikatan.
Bond Length = Menampilkan panjang ikatan.
Bond Angles = Menampilkan sudut ikatan.
Atom Labels = Menampilkan lambang unsur setiap atom.
Partial Charges = Menampilkan muatan parsial setiap atom.
Labels Off = Menyembunyikan lambang unsur.
Molecular Dipole = Menampilkan resultan dipole molekul.
Bond Dioles = Menampilkan dipol setiap ikatan.


Gambar-3. Potensial Elektrostatik Molekul



Gambar-4. Pengaturan Vibrasi Molekul
Silakan pilih Frekuensi/Energi vibrasi.
Dapat juga dengan klik View IR Spectrum pada setiap garis dalam spektrum IR.
Periode vibrasi  dapat diatur untuk waktu tertentu, demikian pula amplitudonya, setelah itu klik Set vibration options.



Gambar-5. Menampilkan Simetri Molekul


Gambar-6. Menampilkan area orbital molekul dengan parameter yang sudah tersedia.


Gambar-7. Dapat pula mendownload gambar dari visual 3D dengan memilii menu Images.


Gambar-8. Menampilkan beberapa bentuk padatan (kristal) senyawa ion maupun kovalen.


Dalam website ini sebenarnya tampilan 3D ini dapat ditanam dalam blog atau website pribadi. Silakan dicoba. Caranya klik menu Export, di bagian atas, kemudian salin kode html dari iframe.

Sayangnya beberapa kali coba 3D molekul dari ChemEdDL ini tidak dapat termuat dalam blog. Mungkin ada yang keliru atau perlu dimodifikasi sendiri. Penulis sendiri lebih suka melakukan embed file dengan menggunakan Jmol langsung.

Setiap 3D molekul yang ditampilkan dalam web ChemEd DL ini dapat diunduh secara individu untuk digunakan secara offline. Hasil download ini selanjutnya dapat dibuka menggunakan Jmol atau Avogadro dan sejenenis.

Demikian semoga bermanfaat.

KSJSS.
Bagikan di

Tidak ada komentar:

Posting Komentar

 
Copyright © 2015-2021 Urip dot Info | Disain Template oleh Herdiansyah Dimodivikasi Urip.Info