Menampilkan Bentuk Molekul dengan Polyhedral Style Menggunakan Vesta

Sabtu, 16 November 2019 edit

Vesta merupakan software untuk pemodelan kristal yang bersifat "gratis". Sampai tulisan ini dibuat sampai di versi 3.4.7. Vesta tidak perlu diinstall di komputer. Download, ekstrak, dan gunakan di sistem operasi yang kita gunakan, dapat dijalankan di Windows, Linux, dan Mac. Kali ini saya buat tutorialnya dengan menggunakan sistem operasi Windows 10, untuk versi windows 8 atau 7 tetap dapat mengikuti tutorial ini
Unduh, Ekstrak, Jalankan
  1. Unduh aplikasi VESTA dari sini. Anda akan mendapatkan file Vesta.zip, biasanya akan terunduh ke folder Download pada Windows
  2. Ekstrak file Vesta.zip ini dengan menggunakan aplikasi semacam 7zip, winzip, winrar.
  3. Buka folder Vesta, ini folder hasil ekstrak Vesta.zip.
  4. Untuk menjalankan aplikasi Vesta klik ganda file Vesta.exe.

Cara menggambar polihedral molekul sederhana

Bagian-1. Membuat model molekul
Ini adalah cara termudah untuk memudahkan menggambar model molekul tanpa mengetahui koordinat pada sumber xyz setiap atom. Model molekul dibuat dengan aplikasi ChemSketch 3D dan menyimpannya dalam format file *.mol atau *.pdb. Misalnya akan dibuat molekul metana (CH4) dan menyimpan filenya dengan nama metana.mol.

Bagian-2. Menampilkan model molekul dengan polyhedra style di Vesta
  1. Buka aplikasi Vesta dengan klik kanan Vesta.exe yang ada ikon dengan ukuran sekitar 28,735 KB.

  2. Klik Menu File pilih Open, cari dan pilih file metana.mol yang sudah dibuat dengan ChemSketch dan klik open, Pilih Polyhera Style.

  3. Klik Menu Edit, pilih Bonds, beri tanda centang kotak Poly.


  4. Selanjutnya lakukan pengubahan warna sisi polyhedral itu sesuai keinginan. Klik Properties dan pindah ke Tab Polyhedra, lihat Plane >> Color dan ubah warnanya. Bila perlu ubah ukuran garis agar lebih besar, kemudian klik Ok.


  5. Selesai.
Untuk menyimpan dalam format gambar dapat di screencapture saja.

Alternatif tutorial dapat dilihat pada video berikut.


Selamat mencoba semoga berhasil.
Bagikan di

Tidak ada komentar:

Posting Komentar

 
Copyright © 2015-2019 Urip dot Info | Disain Template oleh Herdiansyah Dimodivikasi Urip.Info