Berikut ini adalah visual vibrasi beberapa model molekul sederhana menggunakan Jmol. Untuk membuat model molekul dengan vibrasi tertentu diperlukan optimasi energi dengan frekuensi untuk menghasilkan koordinat atom dalam model molekul. Koordinat-koordinat tersebut merupakan hasil komputasi dengan menggunakan aplikasi seperti Gamess, Gaussian, Hyperchem, dan sejenisnya dengan parameter tertentu. Rekaman data ini kemudian dikemas dalam satu file berekstensi xyz atau ekstensi lain (seperti ekstensi out dan log) sehingga dapat divisualkan dengan Jmol.
Vibrasi molekul CO2.
Bagaimana cara mengenerate file-file 3D yang dapat menunjukkan vibrasi model molekul menggunakan data spektroskopi tertentu akan dibahas pada tulisan berikut.
Beberapa tutorial tentang Jmol yang telah ditulis di blog ini dapat ditelusuri dari sini.
Sumber: Visual diadaptasi dari VirtualChemistry3D
Vibrasi molekul CO2.
Vibrasi molekul H2O.
Vibrasi molekul HBr.
Vibrasi molekul H2CO.
Bagaimana cara mengenerate file-file 3D yang dapat menunjukkan vibrasi model molekul menggunakan data spektroskopi tertentu akan dibahas pada tulisan berikut.
Beberapa tutorial tentang Jmol yang telah ditulis di blog ini dapat ditelusuri dari sini.
Sumber: Visual diadaptasi dari VirtualChemistry3D
Tidak ada komentar:
Posting Komentar