Menu dan Tools Penting dalam MarvinSketch untuk Menamplilkan Struktur Molekul

Jumat, 06 Januari 2017

Setiap aplikasi penampil struktur molekul memiliki keunggulannya masing-masing. Kali ini saya akan membahas beberapa menu dan tools penting yang terdapat dalam MarvinSketch. Menu-menu yang cukup jika digunakan menampilkan struktur molekul yang biasa terdapat dalam pelajaran kimia SMA. Iya hanya itu. Hanya dengan menu dan tool berikut bagi guru kimia atau mahasiswa S-1 kimia sudah mencukupi, mencukupi jika sekadar menampilkan struktur seperti yang dikehendakinya.
  1. Menu Edit >> Submenu Preferences >> Tab Structure. Yang paling penting adalah pilihan untuk menampilkan atom C dibagian tertentu atau menyembunyikan atom C.

    Gambar 1. Submenu Preferences - Tab Structure
  2. Menu View >> Implicit Hydrogens: Ini akan menampilkan hidrogen dalam bentuk termampat (misal CH3CH2CH3), tidak terbentang seperti pada Explicite Hydrogen pada Menu Srucuture.

    Gambar 2. Menu View Impicit Hydogens
  3. Menu View >> Submenu Editor style >> Customize... >> Tab Toolbars

    Gambar 3. Menambah toolbar tersembunyi pada Marvin Skecth
  4. Menu View >> Submenu Toolbars >>

    Gambar 4. View >> Submenu Toolbars
  5. Menu View >> Submenu Editor style >> Advanced

    Gambar 5. View >> Submenu Editor style >> Advanced
  6. Menu Structure

    Gambar 6.  Menu Structure
    Beberapa Submenu yang sangat penting untuk memberi tampilan struktur yang diinginkan antara lain:
    • Clean 2D: untuk optimasi struktur molekul secara 2 dimensi
    • Clean in 3D: untuk optimasi struktur molekul secara 3 dimensi
    • Add >> Explicit Hydrogens: untuk menampilkan atom H yang terbentang.
    • Remove >> Explicit Hydrogens: untuk menghilangkan atom H yang terbentang.
    • Aromatic Form: untuk mengubah bezena ke bentuk Kekule ke bentuk cincin atau sebaliknya.
    • Generate Name: untuk mengetahui nama struktur yang digambar sesuai aturan IUPAC.

    Lalu bagaimana dengan menu dan sub menu yang lain? Menu-menu dan submenu-submenu yang lain tentu sangat penting namun kalau sekadar ingin membuat gambar struktur yang umum digunakan pada buku-buku teks kimia SMA atau pada soal-soal ujian itu tidak terlalu penting.

    Jika ingin mendalaminya lebih lanjut silakan baca manual pada bagian Help atau dapat langsung mengunjungi website resmi  ChemAxon.


    Demikian sedikit penjelasan tentang beberapa menu "penting" dalam MarvinSketch, mohon koreksi dari pembaca bila ditemui kekurangtepatan dalam penjelasan di atas. Terima kasih.
    Bagikan di

    Tidak ada komentar:

    Poskan Komentar

     
    Copyright © 2015-2016 Urip dot Info | Disain Template Oleh Herdiansyah Hamzah Dimodivikasi Urip.Info