Pengunduh File 3D Format SDF dari Pubchem dengan Input SMILES

Aplikasi ini memungkinkan pengguna mengambil koordinat 3D molekul dari database PubChem menggunakan kode SMILES sebagai input. Cukup masukkan satu atau beberapa kode SMILES (Simplified Molecular-Input Line-Entry System) per baris, dan aplikasi akan secara otomatis mengunduh data struktur dalam format SDF (Structure Data File). Output dapat berupa file SDF lengkap atau versi sederhana yang hanya berisi informasi koordinat hingga M END. Berguna untuk visualisasi molekul, penelitian kimia komputasi, atau analisis struktur dengan software seperti PyMOL, Chimera, atau Avogadro. Khusus untuk Preview 3D Molekul hanya bisa dimunculkan bila pengguna memasukkan 1 struktur molekul saja.

Read more » 0

Perhitungan Kc Kesetimbangan Heterogen Gas-Larutan

Memahami kesetimbangan antara fase gas dan larutan memerlukan ketelitian ekstra, terutama saat menentukan volume mana yang harus digunakan. Contoh soal di bawah ini akan menunjukkan cara menangani perbedaan volume antara ruang kosong dan volume cairan, serta bagaimana mengubah data tekanan menjadi konsentrasi molar agar dapat dimasukkan ke dalam rumus $K_c$ secara tepat.

Read more » 0

Tata Nama Asam Karboksilat (Asam Alkanoat)

Bahasan berikut akan menjelaskan tata nama untuk asam karboksilat (monokarboksilat, dikarboksilat, polikarboksilat) dan senyawa turunannya dengan gugus fungsi campuran yang fokus pada prioritas dalam tata cara penamaan molekul organik.

Read more » 0

Mengapa Fase Padat dan Cair Tidak Dimasukkan dalam Perhitungan Kc?

Poin Penting: Fase padat (s) dan cairan murni (l) tidak dimasukkan dalam rumus Kc karena konsentrasinya selalu tetap selama reaksi berlangsung. Untuk memahami maksud pernyataan ini sila lanjut menyimak penjelasannya.

Read more » 0

Tata Nama Keton (Alkanon)

Keton adalah senyawa organik yang mengandung gugus fungsi karbonil (C=O) yang terikat pada dua gugus alkil atau aril. Gugus karbonil pada keton berada di tengah rantai karbon, berbeda dengan aldehida yang berada di ujung rantai.

Dalam tulisan ini dibahas penamaan monoketon, diketona, dan poliketon menurut aturan IUPAC, contoh senyawa real, dan sifatnya.

Read more » 0

Anatomi Sebuah Nama: Menguraikan Logika Kimia di Balik "Paracetamol" dan "Acetaminophen"

Parasetamol dan asetaminofen adalah dua nama untuk senyawa kimia yang identik, C₈H₉NO₂. Perbedaan namanya bukanlah kebetulan, melainkan cerminan langsung dari cara sistem nomenklatur kimia organik yang berbeda "membaca" dan "mengurai" struktur molekul yang sama.

Read more » 0

Tata Nama Aldehid (Alkanal)

Aldehid (atau alkanal menurut tata nama IUPAC) adalah senyawa organik yang memiliki gugus fungsi -CHO, yaitu atom karbon yang terikat pada gugus karbonil (C=O) dan atom hidrogen. Dalam sistem penamaan, aldehid memiliki beberapa keunikan dibandingkan golongan senyawa organik lainnya.

Read more » 0

Konverter File SDF ke Format XYZ

Aplikasi konverter SDF (Structure Data File) ke XYZ ini dirancang khusus untuk memudahkan konversi data struktur molekul 3D dari database PubChem ke format XYZ yang kompatibel dengan berbagai software kimia komputasi dan visualisasi molekul.

Read more » 0

Materi Kimia: Biomolekul (Karbohidrat, Lipid, Protein, Asam Nukleat)

Biomolekul merupakan senyawa organik yang menyusun struktur dan menjalankan fungsi biologis pada semua organisme hidup. Klasifikasi biomolekul menjadi empat kelompok utama - karbohidrat, protein, lipid, dan asam nukleat. Hal ini didasarkan pada perbedaan struktur kimia, sifat fisikokimia, dan peran biologisnya.

Materi ini masih dalam tahap pengembangan, belum final.

Read more » 0

Materi Kimia: Benzena dan Turunannya

Pokok Bahasan Terpisah: Senyawa aromatik dipelajari terpisah dari senyawa alifatik karena memiliki sifat, struktur, dan reaksi yang sangat khas (aturan Hückel, resonansi, substitusi elektrofilik aromatik).

Materi ini masih dalam tahap pengembangan, belum final.

Read more » 0

Materi Kimia: Perhitungan Ar dan Mr

Massa Atom Relatif (Ar) adalah perbandingan massa rata-rata satu atom suatu unsur terhadap 1/12 massa satu atom isotop C-12. Ar tidak memiliki satuan karena merupakan besaran relatif.

Read more » 0

Materi Kimia: Polimer

Draft materi polimer untuk kimia kelas 12 SMA.

Polimer adalah makromolekul (molekul raksasa) yang tersusun dari banyak pengulangan unit molekul kecil yang terikat secara kimia.

Kata "polimer" berasal dari bahasa Yunani: poly (banyak) dan meros (bagian). Polimer memiliki peran sangat penting dalam kehidupan sehari-hari, mulai dari plastik, karet, serat sintetis, hingga material biologis seperti protein dan DNA.

Read more » 0

Materi Kimia: Gugus Fungsi Senyawa Organik

Gugus fungsi adalah atom atau kelompok atom yang menentukan sifat karakteristik suatu senyawa organik. Senyawa dengan gugus fungsi yang sama akan memiliki sifat kimia yang mirip, meskipun rumus molekulnya berbeda.

Read more » 0

Membuat File SVG Struktur Molekul

Keunggulan gambar dengan format svg adalah kualitas-nya, gambar format ini merupakan salah satu format gambar vektor, dapat dilakukan pembesaran tanpa menurunkan kualitas. Ukuran file ini relatif kecil. Sampai saat ini admin masih belum mendapatkan cara terbaik untuk menyisipkan gambar struktur molekul format svg yang sudah dibuat di Chemdraw agar ukurannya benar-benar teroptimasi. Masih menggunakan prosedur normal: membuat struktur molekul di Chemdraw; menyimpan sebagai file svg; mengoptimasinya di SVGOMG; download atau salin kode hasil optimasi untuk disisipkan dalam laman/postingan di blog dan selesai.

Read more » 0

Struktur Molekul Format SVG Super Optimizer

Berikut ini aplikasi yang dapat digunakan untuk melakukan re-optimize file gambar struktur molekul berformat svg dari Chemdraw. File SVG ini di-optimize lebih dahulu menggunakan SVGOMG. Lumayan pengurangannya sekitar 50% dari ukuran svg asli dari Chemdraw. Tapi masih ada potensi untuk lebih mengefisienkan sekitar 10-30% dari ukuran output hasil SVGOMG. Pengefisienan ini hanya fokus pada css text/font serta ukuran font yang masih tertulis berulang pada hasil optimasi SVGOMG.

Read more » 0

Materi Kimia: Larutan Elektrolit dan Nonelektrolit

Larutan adalah campuran homogen yang terdiri dari zat terlarut dan pelarut. Berdasarkan daya hantar listriknya, larutan diklasifikasikan menjadi dua jenis: larutan elektrolit dan larutan nonelektrolit.

Read more » 0

Materi Kimia: Sifat Koligatif Larutan Elektrolit dan Nonelektrolit

Sifat koligatif larutan adalah sifat-sifat larutan yang hanya bergantung pada jumlah partikel zat terlarut, bukan pada identitas kimianya. Pokok bahasan ini mencakup empat fenomena utama: penurunan tekanan uap, kenaikan titik didih, penurunan titik beku, dan tekanan osmotik.

Read more » 0

Materi Kimia: Kimia Unsur

Kimia unsur mempelajari sifat, kelimpahan, dan pemanfaatan unsur-unsur dalam kehidupan. Pembahasan ini mencakup pola sifat periodik, metode ekstraksi dari mineral, serta manfaat dan dampaknya bagi manusia dan lingkungan.

Read more » 0

Materi Kimia: Ikatan Kimia, Bentuk Molekul, Gaya Antarpartikel

Fenomena di Sekitar Kita

Pernahkah Anda bertanya mengapa air berbentuk cair pada suhu ruang sementara hidrogen sulfida (H₂S) berbentuk gas? Mengapa garam dapat larut dalam air tetapi tidak dalam minyak? Mengapa logam dapat menghantarkan listrik dengan baik? Semua fenomena ini berkaitan erat dengan ikatan kimia dan struktur molekul.

Read more » 0

Simulasi Animasi 3D Pembentukan Ikatan Koordinasi (Asam-Basa Lewis)

Simulasi interaktif berikut ini akan menunjukkan tiga contoh penting pembentukan ikatan koordinasi melalui pendekatan asam-basa Lewis, dengan visualisasi tiga dimensi yang memungkinkan pemahaman lebih mendalam tentang perubahan geometri molekul dan mekanisme reaksi yang terjadi.

Read more » 1